Përgatitja e mostrës: Izolimi i ADN-së

Për të detektuar me një microarray nëse ADN-ja e një pacienti përmban sekuenca të veçanta, ADN-ja duhet së pari të nxirret nga gjaku i pacientit. Kjo kryhet duke përdorur kite të izolimit të ADN-së.

Amplifikimi i ADN-së së pacientit: Reaksioni zinxhiror i polimerazës (PCR)

Sekuencat e ADN-së që kanë për tu analizuar amplifikohen miliona herë duke përdorur reaksionin zinxhiror të polimerazës (PCR). Dy molekula fillestare të ADN-së (primera) përcaktojnë rajonin që do të kopjohet. Nëse ADN-ja e pacientit përmban sekuencën përkatës (sekuencën e synuar), primerët lidhen dhe sekuenca e synuar kopjohet. Ky reaksion përsëritet shumë herë, në mënyrë që rajoni i ADN-së ndërmjet primerëve të amplifikohet shumë (në mënyrë eksponenciale). Produktet rezultuese të PCR-së etiketohen me një ngjyrë fluoreshente, e cila e mundëson zbulimin e tyre më pas nga microarray. Nëse sekuenca e synuar nuk është e pranishme në mostrën e pacientit, atëherë primerët nuk mund të lidhen dhe ADN-ja nuk amplifikohet.

Analiza e produkteve të PCR në microarray: Hibridizimi i microarray të ADN-së

Produktet e PCR inkubohen me microarray. Ato fillimisht përzihen me një pufer hibridizimi, i cili siguron kushte optimale për lidhjen e produkteve të PCR me probet komplementare në microarray. Kjo lidhje matet nëpërmjet sinjaleve të fluoreshencës të emetuara nga njollat.